scikit-learnを用いた機械学習の初歩②~機械学習モデルの構築・評価~

2018/04/26

python scikit-learn プログラミング

はじめに

 前回の記事では機械学習に用いるデータと機械学習のアルゴリズムの一つである「k近傍法」について説明をしました。今回は実際に学習モデルを構築し、評価を行っていきます。
↓前回の記事

データの分割

 まず初めに、前回の記事で読み込んだ150個あるアヤメのデータをトレーニングデータ(訓練データ、学習用データ)とテストデータ(評価用データ、検証用データ)に分割をします。pythonでデータサイエンスではトレーニングデータとテストデータは一般的に80:20,75:25,70:30の比率で分割するのが一般的とのことでしたので、今回は80:20で分割をしたいと思います。
 ちなみにこのようにデータを一定の割合でトレーニングデータとテストデータに分割することをホールドアウト検証というみたいです。ホールドアウト検証は単純な評価方法の一つですが、①集めたデータを2つに分割するため、学習に使えるデータ量が減ってしまう②分割する際、データに偏りが生じるとうまく評価をすることが出来ないといった2つのデメリットが存在します。
 データの分割はscikit-learnの「sklearn.model_selection.train_test_split」という関数を用います。


sklearn.model_selection.train_test_split(*arrays, **options)


arrays分割対象となる複数のリスト
test_size
小数または、整数で指定。小数の場合はテストデータの割合を指定(1.0で100%)
整数を指定した場合はテストデータに含めるデータ件数となる。
test_sizeを指定していない場合やNoneの場合はtrain_sizeを補うように設定される。
train_sizeを設定していない場合はデフォルト値として0.25となる。
train_size説明としてはtest_sizeとほぼ同じ。トレーニングデータについての指定。
random_state乱数生成のシードの設定。指定しなかった場合はNumpyのrandomを用いて乱数をセットする。
shuffleデータのシャッフルを行うかの指定。デフォルト値:True。
Falseとした場合はstratifyをNoneにする必要がある
stratifystratified samplingを行う場合に、クラスを示す行列を設定する。デフォルト値:None

何個か説明がわからなかった引数がありましたが、とりあえずデータの分割を行ってみます。

from sklearn.model_selection import train_test_split
iris_dataset = load_iris()
X_train,X_test,x_train,x_test = train_test_split(iris_dataset["data"],iris_dataset["target"],test_size = 0.2)

ここでX_trainはトレーニングデータ、X_testはテストデータ、x_trainはトレーニング用の正解ラベル、x_testはテスト用の正解ラベルです。
実際にX_train、X_testの中身を見てみると120個のデータと30個のデータに分割されていて、80:20にデータが分割されていることがわかります。ちなみにデータの順番はシャッフルされています。


import pandas as pd
print(pd.DataFrame(X_train,columns = iris_dataset.feature_names))
print(pd.DataFrame(X_test,columns = iris_dataset.feature_names))
図1:X_trainの中身

機械学習モデルの構築

ようやくすべての準備が整いましたので、実際にk近傍法を用いてクラス分類を行う学習モデルの構築を行います。k近傍法はscikit-learnのKNeighborsClassifierを用います。

sklearn.neighbors.KNeighborsClassifier(n_neighbors=5, weights=’uniform’, algorithm=’auto’, leaf_size=30, p=2, metric=’minkowski’, metric_params=None, n_jobs=1, **kwargs)


n_neighborskの値。デフォルト値:5
weightsデータ間の距離に重み付けをするか。デフォルト:uniform
algorithm近傍点を計算するために用いるアルゴリズム。デフォルト値:auto
leaf_sizeメモリや速度に影響する数字?デフォルト値:30
pミンコフスキー距離のパラメータ。デフォルト値:2
metric距離として何を用いるか。デフォルト値:minkowski
metric_paramsメトリック関数に追加する引数。デフォルト値:None
n_jobs使用するCPUのコア数。-1ですべて使用。デフォルト値:1

やはり何個かよくわからない引数がありますが、とりあえずやってみます。

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
iris_dataset = load_iris()
X_train,X_test,x_train,x_test = train_test_split(iris_dataset["data"],iris_dataset["target"],test_size = 0.2)

knn = KNeighborsClassifier()
knn.fit(X_train, x_train)#fit関数を用いてトレーニングデータの読み込み
X_temp_test = np.array([[4.4,2.9,1.4,0.2]])#学習データの中にあったSetosaのデータ



とりあえずKNeighborsClassifierはデフォルト値としました。作成した学習モデルにfit関数を用いてトレーニングデータの学習を行います。 正しく学習できているかの確認としてトレーニングデータ内にあったSetosaのデータを入力した場合の予想結果を表示したところSetosaとかえって来たので、無事学習できているみたいでした。

モデルの評価

今度はテストデータを使って、今回作成したモデルの精度を評価してみます。


x_pred =knn.predict(X_test)#テストデータを学習モデルにセット
x_judge = x_pred == x_test #予測したデータと答えが一致しているか
true_count = len(np.where(x_judge==True)[0])#正解した数
print(x_judge)
print(true_count/len(x_judge))#正答率

何回か試したところ30個のテストデータの全問正解するか一問だけ間違えるかのどちらかでした。なので正答率は93%から100%といった結果になりました。

まとめ

今回はscikit-learnを用いてアヤメの分類を行いました。
今回のデータの場合は93%以上の精度で予測が可能だということが分かりました。
モデルの評価法として別のやり方があるみたいなので、次回記事としてまとめます。
↓次回記事

自己紹介

はじめまして 社会人になってからバイクやプログラミングなどを始めました。 プログラミングや整備の記事を書いていますが、独学なので間違った情報が多いかもしれません。 間違っている情報や改善点がありましたらコメントしていただけると幸いです。

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